一旦发生未知细菌感染性疾病流行，我国将有快速筛查技术予以应对。近日完成的一项“十五”国家科技攻关课题，研究人员成功建立了未知细菌快速筛查技术体系，他们以16SrRNA序列分析为基础，采取毒力和毒素基因鉴定方法，能够直接使用临床标本，在最短的时间内鉴定未知或不可培养的细菌，对细菌性新发传染病做出准确判定。
课题负责人、中国CDC传染病预防控制所徐建国教授介绍，传统的细菌培养方法已不能适应新发传染病应急处置的需要，而以序列分析为基础，结合表现型分析的鉴定方法，是细菌学检测和鉴定的发展方向。由于16srRNA序列在所有的细菌种都存在，能够满足进行比较的要求，因此课题组选择该序列的分析方法作为鉴定细菌的基础。
经过两年攻关，科研人员建立了相关的数据库和临床标本细菌检测体系，建立了细菌毒力岛和毒素基因检测芯片，建立了重要致病细菌毒素和毒力岛基因的二级核酸数据库及分析软件。其中细菌16SrDNA保守核酸序列数据库属国际首创，细菌毒力岛和毒素基因检测芯片属国内首创。该技术是将临床标本处理后，使用细菌16srRNA的通用引物，直接进行PCR扩增、克隆和测序。然后将获得的16srRNA序列，与已经发表的序列进行比较，同时进行毒力和毒素基因的检测和筛查，从而在新的细菌性传染病出现时，快速做出病原学筛查和判定。
徐建国强调，上述病原菌筛查体系，虽然能够用于未知的细菌检测（其他方法只能检测已知细菌基因），但费用较高，需要时间较长，不适合于常规使用，应主要适合于不明原因的细菌性传染病疫情调查和研究。
